Le CWCS occupe une position importante dans la conservation des zones humides, ayant participé activement au cours des 20 dernières années à la conservation des zones humides côtières et intérieures et aux questions de gestion des aires protégées grâce à la mise en œuvre de deux programmes : le programme de conservation des forêts côtières et des mangroves avec un bureau à Mouanko, dans la région du Littoral, et le projet des zones humides du Haut-Nyong basé dans la région Centre/Est d'Akonolinga. Le CWCS héberge actuellement le secrétariat du Réseau de conservation des mangroves du Cameroun, qui regroupe plus de 40 associations côtières, ONG et groupes d'initiative commune.
Le CWCS réussit largement grâce à son approche participative multipartite pour mettre en œuvre ses projets et programmes communautaires
de conservation de la biodiversité, allant de la planification, du suivi, de l'évaluation à la diffusion des résultats en passant par le développement institutionnel, la recherche scientifique et la sensibilisation politique dans le cadre de ses stratégies visant à garantir des moyens de subsistance durables et la conservation de la biodiversité.